Kościół parafialny został zbudowany prawdopodobnie za czasów Bolesława Krzywoustego i przetrwał do początku XVI w. W 1510 wzniesiono nowy kościół również drewniany, który spłonął podczas pożaru miasta w 1637 r. Nowy kościół zbudowano w 1641 r. ze składek wiernych i dotacji patrona króla Stanisława Augusta Poniatowskiego (miał dwie wieże).
W latach 1905-1906 ks. proboszcz Franciszek Renkawitz rozpoczął budowę obecnej świątyni, która została konsekrowana przez biskupa E. Likowskiego 2 VIII 1907 r.Kościół jest zbudowany w stylu neobarokowym, wieże mają 40 m wysokości. Ołtarze boczne M. B. Różańcowej, Św. Anny, Św. Franciszka, ambona i chrzcielnica pochodzą ze starego kościoła. Obraz w ołtarzu głównym przedstawia św. Mikołaja - patrona kościoła. Po jego obydwu stronach znajdują się figury czterech ewangelistów. W witrażach obok głównego ołtarza (wykonanego przez firmę F. Millera w Quedlinburgu) widzimy św. Stanisława Szczepanowskiego i św. Ottona z Bambergu – apostoła Pomorza, który w 1124 r. był w Ujściu. W czasie II wojny światowej hitlerowcy zamienili kościół na magazyn a piękne ornamenty zniszczyli.
Obok kościoła w dawnym ogrodzie proboszczowskim ks. Renkawitz zbudował w latach 1890-1907 14 stacji drogi krzyżowej. Na specjalny rozkaz A. Graisera (namiestnika Kraju Warty) hitlerowcy zburzyli w 1943 r. wszystkie stacje. Użyto do tej akcji Żydów.
Staraniem ks. Proboszcza Floriana Łodziga na miejscu zburzonej Kalwarii zbudowano kamienne stacje których poświęcenia dokonał 5 VI 1976 r. arcybiskup poznański.
W latach dziewięćdziesiątych z inicjatywy ks. proboszcza Mariana Kozłowskiego rozpoczęto pracę nad „rekonstrukcją”zburzonej Kalwarii. Dzięki wysiłkom całej społeczności ujskiej do tej pory udało się odbudować cztery stacje.

Przy kościele parafialnym w Ujściu w roku 2000 postawiono popiersie Jana Pawła II. Jest ono jedną z nowszych realizacji Roberta Sobocińskiego, utalentowanego rzeźbiarza z Poznania, autora m.in. projektu rekonstrukcji ujskiej Kalwarii. Popiersie z Ujścia odbiega nieco od powszechnego schematu popiersi papieskich. Jedną z podstawowych różnic stanowi nakrycie głowy - tutaj Jan Paweł II przedstawiony został w mitrze.

Na cokole popiersia znajdują się napisy:
WDZIĘCZNI BOGU ZA PAPIEŻA JANA PAWŁA II - RODAKOWI – SPOŁECZEŃSTWO GMINY I MIASTA UJŚCIE W ROKU JUBILEUSZOWYM 2000

Z lewej: „Pamiętajcie, że jestem spośród Was i mam szczególne prawo do Waszych serc i do Waszej modlitwy” Jan Paweł II

Z prawej: Dnia 14 grudnia 1999 r. uchwałą nr X/124/99 Rada Miejska w Ujściu w uznaniu nieocenionych zasług dla Polski i świata nadała Jego Świątobliwości Ojcu Świętemu Janowi Pawłowi II tytuł Honorowego Obywatela Miasta i Gminy Ujście